Doktorský studijní program teologie, obor Katolická teologie (standardní doba studia čtyři roky), připravuje studenty na samostatné vědecké bádání a samostatnou tvůrčí činnost v oblasti teologie.

Studijní program Dějiny křesťanského umění je soustředěn k jednotlivým obdobím dějin umění dle obvyklé periodizace výtvarných děl středověku, raného novověku a umění 19. a 20. století.

Studjní program je zaměřen na vědecký výzkum a samostatnou tvůrčí odbornou činnost v oblasti dějin křesťanství na pozadí obecného vývoje dějin lidské společnosti.